إنّ منظّمة الشؤون الجمركية في المنطقة الخاصّة كجزءٍ من المنظّمة، هي مسؤولة المنطقة (و لا الجمرك للجمهورية الإسلامية الإيرانية)، تتحمّل مهمة القيام بالإجراءات المرتبطة بالتخليص الجمركي أو كلٍّ من النشاطات المرتبطة باستيراد الوحدات الصناعية – التجارية وتصديرها، المستقرة في المنطقة أو التُجّار المتقدّمين بالطلب للاستفادة من خدمات المنطقة حيثُ كانت منصوصاً بها في المواد رقم ۴، ۱۰ و ۱۱ من قانون إنشاء المناطق الاقتصادية الخاصّة والمواد المرتبطة بها في اللائحة التنفيذية للقانون المشار إليه.
إنّ مسؤولية هذه الوحدة ومهامها عبارةٌ عن: